Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTV0

PHF5A, PHD finger-like domain-containing protein 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF5AQ7RTV0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF5AQ7RTV0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF5AQ7RTV0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF5AQ7RTV0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF5AQ7RTV0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF5AQ7RTV0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF5AQ7RTV0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF5AQ7RTV0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF5AQ7RTV0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF5AQ7RTV0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF5AQ7RTV0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF5AQ7RTV0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF5AQ7RTV0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF5AQ7RTV0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF5AQ7RTV0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF5AQ7RTV0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF5AQ7RTV0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PHF5AQ7RTV0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF5AQ7RTV0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF5AQ7RTV0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF5AQ7RTV0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF5AQ7RTV0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF5AQ7RTV0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF5AQ7RTV0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF5AQ7RTV0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF5AQ7RTV0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF5AQ7RTV0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF5AQ7RTV0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF5AQ7RTV0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms