Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYFIP1Q7L576 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYFIP1Q7L576 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CYFIP1Q7L576 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYFIP1Q7L576 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYFIP1Q7L576 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYFIP1Q7L576 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYFIP1Q7L576 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYFIP1Q7L576 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYFIP1Q7L576 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYFIP1Q7L576 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYFIP1Q7L576 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CYFIP1Q7L576 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYFIP1Q7L576 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYFIP1Q7L576 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYFIP1Q7L576 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYFIP1Q7L576 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CYFIP1Q7L576 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYFIP1Q7L576 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYFIP1Q7L576 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYFIP1Q7L576 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYFIP1Q7L576 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYFIP1Q7L576 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYFIP1Q7L576 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYFIP1Q7L576 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYFIP1Q7L576 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYFIP1Q7L576 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYFIP1Q7L576 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYFIP1Q7L576 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYFIP1Q7L576 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYFIP1Q7L576 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYFIP1Q7L576 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYFIP1Q7L576 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYFIP1Q7L576 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CYFIP1Q7L576 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYFIP1Q7L576 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYFIP1Q7L576 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYFIP1Q7L576 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYFIP1Q7L576 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYFIP1Q7L576 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYFIP1Q7L576 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYFIP1Q7L576 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYFIP1Q7L576 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYFIP1Q7L576 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYFIP1Q7L576 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYFIP1Q7L576 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYFIP1Q7L576 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYFIP1Q7L576 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYFIP1Q7L576 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYFIP1Q7L576 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYFIP1Q7L576 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYFIP1Q7L576 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYFIP1Q7L576 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYFIP1Q7L576 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYFIP1Q7L576 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYFIP1Q7L576 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYFIP1Q7L576 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CYFIP1Q7L576 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYFIP1Q7L576 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYFIP1Q7L576 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYFIP1Q7L576 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYFIP1Q7L576 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CYFIP1Q7L576 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYFIP1Q7L576 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYFIP1Q7L576 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYFIP1Q7L576 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYFIP1Q7L576 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYFIP1Q7L576 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CYFIP1Q7L576 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYFIP1Q7L576 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYFIP1Q7L576 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYFIP1Q7L576 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYFIP1Q7L576 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYFIP1Q7L576 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYFIP1Q7L576 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYFIP1Q7L576 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYFIP1Q7L576 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYFIP1Q7L576 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYFIP1Q7L576 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYFIP1Q7L576 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYFIP1Q7L576 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.9 ms