Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SSH2Q76I76 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SSH2Q76I76 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SSH2Q76I76 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SSH2Q76I76 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SSH2Q76I76 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SSH2Q76I76 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
SSH2Q76I76 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SSH2Q76I76 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
SSH2Q76I76 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SSH2Q76I76 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SSH2Q76I76 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SSH2Q76I76 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SSH2Q76I76 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SSH2Q76I76 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SSH2Q76I76 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SSH2Q76I76 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SSH2Q76I76 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SSH2Q76I76 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SSH2Q76I76 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SSH2Q76I76 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SSH2Q76I76 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.13
SSH2Q76I76 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
SSH2Q76I76 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
SSH2Q76I76 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SSH2Q76I76 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SSH2Q76I76 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SSH2Q76I76 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SSH2Q76I76 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SSH2Q76I76 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SSH2Q76I76 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SSH2Q76I76 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SSH2Q76I76 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SSH2Q76I76 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SSH2Q76I76 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SSH2Q76I76 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SSH2Q76I76 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SSH2Q76I76 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
SSH2Q76I76 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SSH2Q76I76 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
SSH2Q76I76 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SSH2Q76I76 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SSH2Q76I76 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SSH2Q76I76 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SSH2Q76I76 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SSH2Q76I76 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SSH2Q76I76 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SSH2Q76I76 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SSH2Q76I76 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SSH2Q76I76 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
SSH2Q76I76 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SSH2Q76I76 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
SSH2Q76I76 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SSH2Q76I76 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SSH2Q76I76 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
SSH2Q76I76 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SSH2Q76I76 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SSH2Q76I76 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SSH2Q76I76 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SSH2Q76I76 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SSH2Q76I76 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SSH2Q76I76 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SSH2Q76I76 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SSH2Q76I76 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SSH2Q76I76 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SSH2Q76I76 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SSH2Q76I76 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SSH2Q76I76 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SSH2Q76I76 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SSH2Q76I76 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SSH2Q76I76 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SSH2Q76I76 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SSH2Q76I76 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SSH2Q76I76 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SSH2Q76I76 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SSH2Q76I76 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SSH2Q76I76 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SSH2Q76I76 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SSH2Q76I76 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SSH2Q76I76 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SSH2Q76I76 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
SSH2Q76I76 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SSH2Q76I76 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
SSH2Q76I76 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SSH2Q76I76 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SSH2Q76I76 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SSH2Q76I76 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SSH2Q76I76 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SSH2Q76I76 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
SSH2Q76I76 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SSH2Q76I76 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SSH2Q76I76 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SSH2Q76I76 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SSH2Q76I76 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
SSH2Q76I76 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
SSH2Q76I76 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SSH2Q76I76 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SSH2Q76I76 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SSH2Q76I76 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SSH2Q76I76 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms