Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
USP31Q70CQ4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
USP31Q70CQ4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
USP31Q70CQ4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
USP31Q70CQ4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
USP31Q70CQ4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
USP31Q70CQ4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
USP31Q70CQ4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
USP31Q70CQ4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
USP31Q70CQ4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
USP31Q70CQ4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
USP31Q70CQ4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
USP31Q70CQ4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
USP31Q70CQ4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
USP31Q70CQ4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
USP31Q70CQ4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
USP31Q70CQ4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
USP31Q70CQ4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
USP31Q70CQ4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
USP31Q70CQ4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
USP31Q70CQ4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
USP31Q70CQ4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
USP31Q70CQ4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
USP31Q70CQ4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
USP31Q70CQ4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
USP31Q70CQ4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
USP31Q70CQ4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
USP31Q70CQ4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
USP31Q70CQ4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
USP31Q70CQ4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
USP31Q70CQ4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
USP31Q70CQ4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
USP31Q70CQ4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
USP31Q70CQ4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
USP31Q70CQ4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
USP31Q70CQ4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
USP31Q70CQ4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
USP31Q70CQ4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
USP31Q70CQ4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
USP31Q70CQ4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
USP31Q70CQ4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
USP31Q70CQ4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
USP31Q70CQ4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
USP31Q70CQ4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
USP31Q70CQ4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
USP31Q70CQ4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
USP31Q70CQ4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
USP31Q70CQ4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
USP31Q70CQ4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
USP31Q70CQ4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
USP31Q70CQ4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP31Q70CQ4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP31Q70CQ4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
USP31Q70CQ4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
USP31Q70CQ4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
USP31Q70CQ4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP31Q70CQ4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP31Q70CQ4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP31Q70CQ4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP31Q70CQ4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP31Q70CQ4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
USP31Q70CQ4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
USP31Q70CQ4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
USP31Q70CQ4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
USP31Q70CQ4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
USP31Q70CQ4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
USP31Q70CQ4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
USP31Q70CQ4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
USP31Q70CQ4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
USP31Q70CQ4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
USP31Q70CQ4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
USP31Q70CQ4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
USP31Q70CQ4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
USP31Q70CQ4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
USP31Q70CQ4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
USP31Q70CQ4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms