Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PACS1Q6VY07 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PACS1Q6VY07 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PACS1Q6VY07 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PACS1Q6VY07 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PACS1Q6VY07 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PACS1Q6VY07 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PACS1Q6VY07 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PACS1Q6VY07 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PACS1Q6VY07 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PACS1Q6VY07 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACS1Q6VY07 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACS1Q6VY07 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACS1Q6VY07 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACS1Q6VY07 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACS1Q6VY07 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACS1Q6VY07 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACS1Q6VY07 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACS1Q6VY07 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACS1Q6VY07 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACS1Q6VY07 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACS1Q6VY07 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PACS1Q6VY07 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PACS1Q6VY07 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PACS1Q6VY07 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PACS1Q6VY07 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PACS1Q6VY07 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PACS1Q6VY07 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PACS1Q6VY07 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PACS1Q6VY07 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PACS1Q6VY07 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PACS1Q6VY07 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PACS1Q6VY07 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PACS1Q6VY07 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PACS1Q6VY07 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PACS1Q6VY07 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PACS1Q6VY07 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PACS1Q6VY07 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PACS1Q6VY07 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PACS1Q6VY07 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PACS1Q6VY07 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PACS1Q6VY07 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PACS1Q6VY07 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PACS1Q6VY07 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PACS1Q6VY07 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PACS1Q6VY07 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PACS1Q6VY07 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PACS1Q6VY07 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PACS1Q6VY07 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PACS1Q6VY07 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PACS1Q6VY07 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PACS1Q6VY07 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PACS1Q6VY07 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PACS1Q6VY07 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PACS1Q6VY07 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PACS1Q6VY07 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PACS1Q6VY07 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PACS1Q6VY07 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PACS1Q6VY07 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PACS1Q6VY07 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PACS1Q6VY07 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PACS1Q6VY07 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PACS1Q6VY07 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PACS1Q6VY07 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PACS1Q6VY07 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PACS1Q6VY07 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PACS1Q6VY07 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PACS1Q6VY07 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PACS1Q6VY07 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PACS1Q6VY07 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PACS1Q6VY07 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PACS1Q6VY07 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PACS1Q6VY07 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PACS1Q6VY07 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PACS1Q6VY07 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PACS1Q6VY07 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PACS1Q6VY07 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PACS1Q6VY07 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PACS1Q6VY07 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PACS1Q6VY07 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PACS1Q6VY07 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PACS1Q6VY07 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PACS1Q6VY07 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PACS1Q6VY07 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PACS1Q6VY07 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PACS1Q6VY07 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PACS1Q6VY07 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PACS1Q6VY07 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PACS1Q6VY07 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PACS1Q6VY07 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PACS1Q6VY07 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PACS1Q6VY07 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PACS1Q6VY07 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PACS1Q6VY07 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PACS1Q6VY07 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PACS1Q6VY07 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PACS1Q6VY07 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PACS1Q6VY07 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PACS1Q6VY07 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PACS1Q6VY07 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms