Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBLN3Q6UW01 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBLN3Q6UW01 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBLN3Q6UW01 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBLN3Q6UW01 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBLN3Q6UW01 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CBLN3Q6UW01 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBLN3Q6UW01 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBLN3Q6UW01 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBLN3Q6UW01 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CBLN3Q6UW01 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBLN3Q6UW01 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBLN3Q6UW01 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBLN3Q6UW01 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBLN3Q6UW01 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBLN3Q6UW01 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBLN3Q6UW01 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBLN3Q6UW01 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBLN3Q6UW01 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBLN3Q6UW01 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBLN3Q6UW01 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBLN3Q6UW01 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBLN3Q6UW01 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBLN3Q6UW01 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBLN3Q6UW01 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBLN3Q6UW01 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBLN3Q6UW01 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBLN3Q6UW01 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CBLN3Q6UW01 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CBLN3Q6UW01 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBLN3Q6UW01 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBLN3Q6UW01 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBLN3Q6UW01 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBLN3Q6UW01 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBLN3Q6UW01 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBLN3Q6UW01 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBLN3Q6UW01 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBLN3Q6UW01 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBLN3Q6UW01 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBLN3Q6UW01 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBLN3Q6UW01 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBLN3Q6UW01 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBLN3Q6UW01 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBLN3Q6UW01 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBLN3Q6UW01 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBLN3Q6UW01 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBLN3Q6UW01 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBLN3Q6UW01 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBLN3Q6UW01 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBLN3Q6UW01 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CBLN3Q6UW01 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBLN3Q6UW01 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBLN3Q6UW01 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBLN3Q6UW01 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBLN3Q6UW01 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBLN3Q6UW01 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBLN3Q6UW01 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBLN3Q6UW01 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBLN3Q6UW01 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBLN3Q6UW01 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBLN3Q6UW01 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBLN3Q6UW01 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBLN3Q6UW01 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBLN3Q6UW01 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBLN3Q6UW01 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBLN3Q6UW01 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBLN3Q6UW01 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBLN3Q6UW01 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBLN3Q6UW01 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBLN3Q6UW01 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBLN3Q6UW01 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CBLN3Q6UW01 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CBLN3Q6UW01 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CBLN3Q6UW01 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBLN3Q6UW01 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms