Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB35

MTHFD1L, Monofunctional C1-tetrahydrofolate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1LQ6UB35 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MTHFD1LQ6UB35 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MTHFD1LQ6UB35 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTHFD1LQ6UB35 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTHFD1LQ6UB35 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTHFD1LQ6UB35 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTHFD1LQ6UB35 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTHFD1LQ6UB35 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTHFD1LQ6UB35 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTHFD1LQ6UB35 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTHFD1LQ6UB35 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTHFD1LQ6UB35 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTHFD1LQ6UB35 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTHFD1LQ6UB35 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTHFD1LQ6UB35 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTHFD1LQ6UB35 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTHFD1LQ6UB35 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MTHFD1LQ6UB35 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MTHFD1LQ6UB35 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MTHFD1LQ6UB35 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MTHFD1LQ6UB35 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTHFD1LQ6UB35 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTHFD1LQ6UB35 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTHFD1LQ6UB35 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTHFD1LQ6UB35 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MTHFD1LQ6UB35 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTHFD1LQ6UB35 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTHFD1LQ6UB35 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTHFD1LQ6UB35 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTHFD1LQ6UB35 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTHFD1LQ6UB35 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTHFD1LQ6UB35 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTHFD1LQ6UB35 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTHFD1LQ6UB35 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTHFD1LQ6UB35 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTHFD1LQ6UB35 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTHFD1LQ6UB35 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTHFD1LQ6UB35 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTHFD1LQ6UB35 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MTHFD1LQ6UB35 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTHFD1LQ6UB35 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTHFD1LQ6UB35 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTHFD1LQ6UB35 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MTHFD1LQ6UB35 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MTHFD1LQ6UB35 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTHFD1LQ6UB35 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTHFD1LQ6UB35 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MTHFD1LQ6UB35 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTHFD1LQ6UB35 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTHFD1LQ6UB35 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTHFD1LQ6UB35 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTHFD1LQ6UB35 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTHFD1LQ6UB35 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTHFD1LQ6UB35 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MTHFD1LQ6UB35 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTHFD1LQ6UB35 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MTHFD1LQ6UB35 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTHFD1LQ6UB35 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTHFD1LQ6UB35 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTHFD1LQ6UB35 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTHFD1LQ6UB35 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTHFD1LQ6UB35 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MTHFD1LQ6UB35 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MTHFD1LQ6UB35 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MTHFD1LQ6UB35 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MTHFD1LQ6UB35 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MTHFD1LQ6UB35 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
MTHFD1LQ6UB35 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MTHFD1LQ6UB35 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTHFD1LQ6UB35 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTHFD1LQ6UB35 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTHFD1LQ6UB35 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTHFD1LQ6UB35 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTHFD1LQ6UB35 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTHFD1LQ6UB35 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTHFD1LQ6UB35 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTHFD1LQ6UB35 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTHFD1LQ6UB35 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MTHFD1LQ6UB35 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MTHFD1LQ6UB35 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MTHFD1LQ6UB35 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTHFD1LQ6UB35 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTHFD1LQ6UB35 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTHFD1LQ6UB35 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTHFD1LQ6UB35 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTHFD1LQ6UB35 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MTHFD1LQ6UB35 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MTHFD1LQ6UB35 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MTHFD1LQ6UB35 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MTHFD1LQ6UB35 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MTHFD1LQ6UB35 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MTHFD1LQ6UB35 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MTHFD1LQ6UB35 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MTHFD1LQ6UB35 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MTHFD1LQ6UB35 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MTHFD1LQ6UB35 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MTHFD1LQ6UB35 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MTHFD1LQ6UB35 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MTHFD1LQ6UB35 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MTHFD1LQ6UB35 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms