Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCE2Q6PIF2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYCE2Q6PIF2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SYCE2Q6PIF2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYCE2Q6PIF2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYCE2Q6PIF2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYCE2Q6PIF2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCE2Q6PIF2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCE2Q6PIF2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYCE2Q6PIF2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCE2Q6PIF2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCE2Q6PIF2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCE2Q6PIF2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCE2Q6PIF2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYCE2Q6PIF2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCE2Q6PIF2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYCE2Q6PIF2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCE2Q6PIF2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCE2Q6PIF2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCE2Q6PIF2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCE2Q6PIF2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCE2Q6PIF2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCE2Q6PIF2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYCE2Q6PIF2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCE2Q6PIF2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCE2Q6PIF2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCE2Q6PIF2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYCE2Q6PIF2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCE2Q6PIF2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYCE2Q6PIF2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCE2Q6PIF2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCE2Q6PIF2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYCE2Q6PIF2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCE2Q6PIF2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCE2Q6PIF2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCE2Q6PIF2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYCE2Q6PIF2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCE2Q6PIF2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCE2Q6PIF2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCE2Q6PIF2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCE2Q6PIF2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCE2Q6PIF2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYCE2Q6PIF2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCE2Q6PIF2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCE2Q6PIF2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYCE2Q6PIF2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCE2Q6PIF2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCE2Q6PIF2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCE2Q6PIF2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCE2Q6PIF2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SYCE2Q6PIF2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCE2Q6PIF2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCE2Q6PIF2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCE2Q6PIF2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SYCE2Q6PIF2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYCE2Q6PIF2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCE2Q6PIF2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCE2Q6PIF2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCE2Q6PIF2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCE2Q6PIF2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCE2Q6PIF2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCE2Q6PIF2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCE2Q6PIF2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCE2Q6PIF2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCE2Q6PIF2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCE2Q6PIF2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYCE2Q6PIF2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYCE2Q6PIF2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYCE2Q6PIF2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYCE2Q6PIF2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYCE2Q6PIF2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYCE2Q6PIF2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SYCE2Q6PIF2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCE2Q6PIF2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCE2Q6PIF2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCE2Q6PIF2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCE2Q6PIF2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCE2Q6PIF2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCE2Q6PIF2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCE2Q6PIF2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCE2Q6PIF2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCE2Q6PIF2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCE2Q6PIF2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCE2Q6PIF2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCE2Q6PIF2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCE2Q6PIF2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCE2Q6PIF2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCE2Q6PIF2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCE2Q6PIF2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCE2Q6PIF2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCE2Q6PIF2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCE2Q6PIF2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCE2Q6PIF2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYCE2Q6PIF2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYCE2Q6PIF2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYCE2Q6PIF2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCE2Q6PIF2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCE2Q6PIF2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCE2Q6PIF2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCE2Q6PIF2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms