Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RFWD3Q6PCD5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RFWD3Q6PCD5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RFWD3Q6PCD5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RFWD3Q6PCD5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RFWD3Q6PCD5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RFWD3Q6PCD5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RFWD3Q6PCD5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFWD3Q6PCD5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFWD3Q6PCD5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RFWD3Q6PCD5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFWD3Q6PCD5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFWD3Q6PCD5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFWD3Q6PCD5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFWD3Q6PCD5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RFWD3Q6PCD5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFWD3Q6PCD5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFWD3Q6PCD5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFWD3Q6PCD5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFWD3Q6PCD5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFWD3Q6PCD5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFWD3Q6PCD5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFWD3Q6PCD5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RFWD3Q6PCD5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RFWD3Q6PCD5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RFWD3Q6PCD5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFWD3Q6PCD5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFWD3Q6PCD5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFWD3Q6PCD5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFWD3Q6PCD5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFWD3Q6PCD5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFWD3Q6PCD5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFWD3Q6PCD5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFWD3Q6PCD5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFWD3Q6PCD5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RFWD3Q6PCD5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFWD3Q6PCD5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFWD3Q6PCD5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFWD3Q6PCD5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFWD3Q6PCD5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFWD3Q6PCD5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFWD3Q6PCD5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFWD3Q6PCD5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFWD3Q6PCD5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFWD3Q6PCD5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFWD3Q6PCD5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFWD3Q6PCD5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFWD3Q6PCD5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFWD3Q6PCD5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFWD3Q6PCD5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFWD3Q6PCD5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RFWD3Q6PCD5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFWD3Q6PCD5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RFWD3Q6PCD5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFWD3Q6PCD5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFWD3Q6PCD5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFWD3Q6PCD5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFWD3Q6PCD5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFWD3Q6PCD5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFWD3Q6PCD5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFWD3Q6PCD5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RFWD3Q6PCD5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RFWD3Q6PCD5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RFWD3Q6PCD5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RFWD3Q6PCD5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms