Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F7

LRRC8B, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8BQ6P9F7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC8BQ6P9F7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC8BQ6P9F7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC8BQ6P9F7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC8BQ6P9F7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC8BQ6P9F7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC8BQ6P9F7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC8BQ6P9F7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC8BQ6P9F7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC8BQ6P9F7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC8BQ6P9F7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC8BQ6P9F7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC8BQ6P9F7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC8BQ6P9F7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC8BQ6P9F7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC8BQ6P9F7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC8BQ6P9F7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC8BQ6P9F7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC8BQ6P9F7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC8BQ6P9F7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC8BQ6P9F7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC8BQ6P9F7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC8BQ6P9F7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC8BQ6P9F7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC8BQ6P9F7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC8BQ6P9F7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC8BQ6P9F7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC8BQ6P9F7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC8BQ6P9F7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC8BQ6P9F7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC8BQ6P9F7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC8BQ6P9F7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC8BQ6P9F7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC8BQ6P9F7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC8BQ6P9F7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC8BQ6P9F7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC8BQ6P9F7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC8BQ6P9F7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC8BQ6P9F7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC8BQ6P9F7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC8BQ6P9F7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC8BQ6P9F7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC8BQ6P9F7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC8BQ6P9F7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC8BQ6P9F7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC8BQ6P9F7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC8BQ6P9F7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC8BQ6P9F7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC8BQ6P9F7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC8BQ6P9F7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC8BQ6P9F7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC8BQ6P9F7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC8BQ6P9F7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC8BQ6P9F7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRC8BQ6P9F7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC8BQ6P9F7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC8BQ6P9F7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC8BQ6P9F7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC8BQ6P9F7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC8BQ6P9F7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC8BQ6P9F7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC8BQ6P9F7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC8BQ6P9F7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC8BQ6P9F7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC8BQ6P9F7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC8BQ6P9F7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC8BQ6P9F7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC8BQ6P9F7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC8BQ6P9F7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC8BQ6P9F7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC8BQ6P9F7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms