Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF544Q6NX49 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF544Q6NX49 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF544Q6NX49 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF544Q6NX49 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF544Q6NX49 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF544Q6NX49 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF544Q6NX49 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF544Q6NX49 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF544Q6NX49 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF544Q6NX49 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF544Q6NX49 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF544Q6NX49 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF544Q6NX49 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF544Q6NX49 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF544Q6NX49 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF544Q6NX49 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF544Q6NX49 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF544Q6NX49 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF544Q6NX49 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF544Q6NX49 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF544Q6NX49 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF544Q6NX49 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms