Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PRPF40BQ6NWY9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PRPF40BQ6NWY9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PRPF40BQ6NWY9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PRPF40BQ6NWY9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRPF40BQ6NWY9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRPF40BQ6NWY9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRPF40BQ6NWY9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRPF40BQ6NWY9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PRPF40BQ6NWY9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
PRPF40BQ6NWY9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
PRPF40BQ6NWY9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PRPF40BQ6NWY9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PRPF40BQ6NWY9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PRPF40BQ6NWY9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PRPF40BQ6NWY9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRPF40BQ6NWY9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRPF40BQ6NWY9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PRPF40BQ6NWY9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PRPF40BQ6NWY9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PRPF40BQ6NWY9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PRPF40BQ6NWY9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PRPF40BQ6NWY9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PRPF40BQ6NWY9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PRPF40BQ6NWY9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PRPF40BQ6NWY9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PRPF40BQ6NWY9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRPF40BQ6NWY9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRPF40BQ6NWY9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRPF40BQ6NWY9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRPF40BQ6NWY9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRPF40BQ6NWY9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PRPF40BQ6NWY9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRPF40BQ6NWY9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRPF40BQ6NWY9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRPF40BQ6NWY9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRPF40BQ6NWY9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRPF40BQ6NWY9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRPF40BQ6NWY9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PRPF40BQ6NWY9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PRPF40BQ6NWY9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
PRPF40BQ6NWY9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRPF40BQ6NWY9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PRPF40BQ6NWY9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRPF40BQ6NWY9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRPF40BQ6NWY9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRPF40BQ6NWY9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PRPF40BQ6NWY9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PRPF40BQ6NWY9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRPF40BQ6NWY9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRPF40BQ6NWY9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PRPF40BQ6NWY9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PRPF40BQ6NWY9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
PRPF40BQ6NWY9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRPF40BQ6NWY9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRPF40BQ6NWY9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRPF40BQ6NWY9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRPF40BQ6NWY9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRPF40BQ6NWY9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRPF40BQ6NWY9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRPF40BQ6NWY9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRPF40BQ6NWY9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRPF40BQ6NWY9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRPF40BQ6NWY9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PRPF40BQ6NWY9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PRPF40BQ6NWY9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
PRPF40BQ6NWY9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PRPF40BQ6NWY9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRPF40BQ6NWY9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRPF40BQ6NWY9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRPF40BQ6NWY9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms