Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC70Q6NSX1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC70Q6NSX1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC70Q6NSX1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC70Q6NSX1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC70Q6NSX1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC70Q6NSX1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC70Q6NSX1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC70Q6NSX1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC70Q6NSX1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC70Q6NSX1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC70Q6NSX1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC70Q6NSX1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC70Q6NSX1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC70Q6NSX1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC70Q6NSX1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC70Q6NSX1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC70Q6NSX1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC70Q6NSX1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC70Q6NSX1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC70Q6NSX1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC70Q6NSX1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC70Q6NSX1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC70Q6NSX1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC70Q6NSX1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC70Q6NSX1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC70Q6NSX1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC70Q6NSX1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC70Q6NSX1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC70Q6NSX1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC70Q6NSX1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC70Q6NSX1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC70Q6NSX1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC70Q6NSX1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC70Q6NSX1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC70Q6NSX1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC70Q6NSX1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC70Q6NSX1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC70Q6NSX1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms