Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
USPL1Q5W0Q7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
USPL1Q5W0Q7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
USPL1Q5W0Q7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
USPL1Q5W0Q7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
USPL1Q5W0Q7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
USPL1Q5W0Q7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
USPL1Q5W0Q7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
USPL1Q5W0Q7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
USPL1Q5W0Q7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
USPL1Q5W0Q7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
USPL1Q5W0Q7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
USPL1Q5W0Q7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
USPL1Q5W0Q7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
USPL1Q5W0Q7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
USPL1Q5W0Q7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
USPL1Q5W0Q7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
USPL1Q5W0Q7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
USPL1Q5W0Q7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
USPL1Q5W0Q7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
USPL1Q5W0Q7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
USPL1Q5W0Q7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
USPL1Q5W0Q7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
USPL1Q5W0Q7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
USPL1Q5W0Q7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
USPL1Q5W0Q7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
USPL1Q5W0Q7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
USPL1Q5W0Q7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
USPL1Q5W0Q7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
USPL1Q5W0Q7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
USPL1Q5W0Q7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
USPL1Q5W0Q7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
USPL1Q5W0Q7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
USPL1Q5W0Q7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
USPL1Q5W0Q7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
USPL1Q5W0Q7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
USPL1Q5W0Q7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
USPL1Q5W0Q7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
USPL1Q5W0Q7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
USPL1Q5W0Q7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
USPL1Q5W0Q7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
USPL1Q5W0Q7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
USPL1Q5W0Q7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
USPL1Q5W0Q7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
USPL1Q5W0Q7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
USPL1Q5W0Q7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
USPL1Q5W0Q7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
USPL1Q5W0Q7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
USPL1Q5W0Q7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
USPL1Q5W0Q7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
USPL1Q5W0Q7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
USPL1Q5W0Q7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
USPL1Q5W0Q7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
USPL1Q5W0Q7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
USPL1Q5W0Q7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
USPL1Q5W0Q7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
USPL1Q5W0Q7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
USPL1Q5W0Q7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
USPL1Q5W0Q7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
USPL1Q5W0Q7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
USPL1Q5W0Q7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
USPL1Q5W0Q7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
USPL1Q5W0Q7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
USPL1Q5W0Q7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
USPL1Q5W0Q7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
USPL1Q5W0Q7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
USPL1Q5W0Q7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
USPL1Q5W0Q7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
USPL1Q5W0Q7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
USPL1Q5W0Q7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
USPL1Q5W0Q7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
USPL1Q5W0Q7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
USPL1Q5W0Q7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
USPL1Q5W0Q7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
USPL1Q5W0Q7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
USPL1Q5W0Q7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
USPL1Q5W0Q7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
USPL1Q5W0Q7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
USPL1Q5W0Q7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
USPL1Q5W0Q7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
USPL1Q5W0Q7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
USPL1Q5W0Q7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
USPL1Q5W0Q7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
USPL1Q5W0Q7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
USPL1Q5W0Q7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
USPL1Q5W0Q7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
USPL1Q5W0Q7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
USPL1Q5W0Q7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
USPL1Q5W0Q7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
USPL1Q5W0Q7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32■■■□□ 2.71
USPL1Q5W0Q7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
USPL1Q5W0Q7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
USPL1Q5W0Q7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
USPL1Q5W0Q7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
USPL1Q5W0Q7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
USPL1Q5W0Q7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
USPL1Q5W0Q7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
USPL1Q5W0Q7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
USPL1Q5W0Q7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
USPL1Q5W0Q7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms