Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
FOCADQ5VW36 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
FOCADQ5VW36 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
FOCADQ5VW36 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
FOCADQ5VW36 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOCADQ5VW36 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOCADQ5VW36 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FOCADQ5VW36 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOCADQ5VW36 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOCADQ5VW36 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOCADQ5VW36 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOCADQ5VW36 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FOCADQ5VW36 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FOCADQ5VW36 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOCADQ5VW36 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOCADQ5VW36 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOCADQ5VW36 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOCADQ5VW36 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FOCADQ5VW36 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOCADQ5VW36 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOCADQ5VW36 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FOCADQ5VW36 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
FOCADQ5VW36 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FOCADQ5VW36 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FOCADQ5VW36 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOCADQ5VW36 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOCADQ5VW36 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FOCADQ5VW36 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
FOCADQ5VW36 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOCADQ5VW36 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FOCADQ5VW36 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOCADQ5VW36 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOCADQ5VW36 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOCADQ5VW36 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FOCADQ5VW36 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOCADQ5VW36 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOCADQ5VW36 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOCADQ5VW36 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOCADQ5VW36 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FOCADQ5VW36 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
FOCADQ5VW36 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
FOCADQ5VW36 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
FOCADQ5VW36 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FOCADQ5VW36 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
FOCADQ5VW36 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FOCADQ5VW36 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30■■■□□ 2.39
FOCADQ5VW36 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
FOCADQ5VW36 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOCADQ5VW36 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOCADQ5VW36 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FOCADQ5VW36 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FOCADQ5VW36 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FOCADQ5VW36 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FOCADQ5VW36 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FOCADQ5VW36 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FOCADQ5VW36 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOCADQ5VW36 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOCADQ5VW36 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOCADQ5VW36 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOCADQ5VW36 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FOCADQ5VW36 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
FOCADQ5VW36 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOCADQ5VW36 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOCADQ5VW36 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOCADQ5VW36 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOCADQ5VW36 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FOCADQ5VW36 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FOCADQ5VW36 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FOCADQ5VW36 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FOCADQ5VW36 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FOCADQ5VW36 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FOCADQ5VW36 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FOCADQ5VW36 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FOCADQ5VW36 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FOCADQ5VW36 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FOCADQ5VW36 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FOCADQ5VW36 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FOCADQ5VW36 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FOCADQ5VW36 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FOCADQ5VW36 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FOCADQ5VW36 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
FOCADQ5VW36 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FOCADQ5VW36 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
FOCADQ5VW36 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FOCADQ5VW36 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
FOCADQ5VW36 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
FOCADQ5VW36 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FOCADQ5VW36 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FOCADQ5VW36 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FOCADQ5VW36 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FOCADQ5VW36 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
FOCADQ5VW36 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FOCADQ5VW36 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FOCADQ5VW36 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FOCADQ5VW36 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
FOCADQ5VW36 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FOCADQ5VW36 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FOCADQ5VW36 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FOCADQ5VW36 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FOCADQ5VW36 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.1 ms