Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
EFCAB2Q5VUJ9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
EFCAB2Q5VUJ9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
EFCAB2Q5VUJ9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
EFCAB2Q5VUJ9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
EFCAB2Q5VUJ9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
EFCAB2Q5VUJ9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
EFCAB2Q5VUJ9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC38.91■■■■□ 3.82
EFCAB2Q5VUJ9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
EFCAB2Q5VUJ9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
EFCAB2Q5VUJ9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
EFCAB2Q5VUJ9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
EFCAB2Q5VUJ9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
EFCAB2Q5VUJ9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
EFCAB2Q5VUJ9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
EFCAB2Q5VUJ9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
EFCAB2Q5VUJ9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
EFCAB2Q5VUJ9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
EFCAB2Q5VUJ9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
EFCAB2Q5VUJ9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
EFCAB2Q5VUJ9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
EFCAB2Q5VUJ9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
EFCAB2Q5VUJ9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
EFCAB2Q5VUJ9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
EFCAB2Q5VUJ9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
EFCAB2Q5VUJ9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
EFCAB2Q5VUJ9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC38.85■■■■□ 3.81
EFCAB2Q5VUJ9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
EFCAB2Q5VUJ9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
EFCAB2Q5VUJ9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
EFCAB2Q5VUJ9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
EFCAB2Q5VUJ9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
EFCAB2Q5VUJ9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
EFCAB2Q5VUJ9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
EFCAB2Q5VUJ9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
EFCAB2Q5VUJ9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
EFCAB2Q5VUJ9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
EFCAB2Q5VUJ9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
EFCAB2Q5VUJ9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
EFCAB2Q5VUJ9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
EFCAB2Q5VUJ9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
EFCAB2Q5VUJ9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
EFCAB2Q5VUJ9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
EFCAB2Q5VUJ9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
EFCAB2Q5VUJ9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
EFCAB2Q5VUJ9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
EFCAB2Q5VUJ9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
EFCAB2Q5VUJ9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
EFCAB2Q5VUJ9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC38.75■■■■□ 3.79
EFCAB2Q5VUJ9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
EFCAB2Q5VUJ9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
EFCAB2Q5VUJ9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
EFCAB2Q5VUJ9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
EFCAB2Q5VUJ9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
EFCAB2Q5VUJ9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
EFCAB2Q5VUJ9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
EFCAB2Q5VUJ9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
EFCAB2Q5VUJ9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC38.7■■■■□ 3.79
EFCAB2Q5VUJ9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
EFCAB2Q5VUJ9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.69■■■■□ 3.78
EFCAB2Q5VUJ9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
EFCAB2Q5VUJ9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
EFCAB2Q5VUJ9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
EFCAB2Q5VUJ9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
EFCAB2Q5VUJ9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
EFCAB2Q5VUJ9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
EFCAB2Q5VUJ9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC38.66■■■■□ 3.78
EFCAB2Q5VUJ9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
EFCAB2Q5VUJ9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
EFCAB2Q5VUJ9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
EFCAB2Q5VUJ9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
EFCAB2Q5VUJ9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
EFCAB2Q5VUJ9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
EFCAB2Q5VUJ9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
EFCAB2Q5VUJ9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
EFCAB2Q5VUJ9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
EFCAB2Q5VUJ9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
EFCAB2Q5VUJ9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
EFCAB2Q5VUJ9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
EFCAB2Q5VUJ9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
EFCAB2Q5VUJ9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
EFCAB2Q5VUJ9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
EFCAB2Q5VUJ9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
EFCAB2Q5VUJ9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
EFCAB2Q5VUJ9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
EFCAB2Q5VUJ9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
EFCAB2Q5VUJ9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
EFCAB2Q5VUJ9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
EFCAB2Q5VUJ9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
EFCAB2Q5VUJ9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
EFCAB2Q5VUJ9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
EFCAB2Q5VUJ9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
EFCAB2Q5VUJ9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
EFCAB2Q5VUJ9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
EFCAB2Q5VUJ9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
EFCAB2Q5VUJ9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
EFCAB2Q5VUJ9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
EFCAB2Q5VUJ9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms