Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF17Q5VTA0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF17Q5VTA0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF17Q5VTA0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF17Q5VTA0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF17Q5VTA0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF17Q5VTA0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF17Q5VTA0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF17Q5VTA0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF17Q5VTA0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF17Q5VTA0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF17Q5VTA0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF17Q5VTA0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF17Q5VTA0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF17Q5VTA0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF17Q5VTA0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF17Q5VTA0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF17Q5VTA0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF17Q5VTA0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF17Q5VTA0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRAMEF17Q5VTA0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF17Q5VTA0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF17Q5VTA0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF17Q5VTA0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF17Q5VTA0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF17Q5VTA0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF17Q5VTA0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF17Q5VTA0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF17Q5VTA0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF17Q5VTA0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF17Q5VTA0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF17Q5VTA0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF17Q5VTA0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF17Q5VTA0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF17Q5VTA0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF17Q5VTA0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF17Q5VTA0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF17Q5VTA0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF17Q5VTA0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF17Q5VTA0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF17Q5VTA0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF17Q5VTA0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF17Q5VTA0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF17Q5VTA0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF17Q5VTA0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF17Q5VTA0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRAMEF17Q5VTA0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms