Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SAMD5Q5TGI4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD5Q5TGI4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms