Protein–RNA interactions for Protein: Q5T447

HECTD3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD3Q5T447 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HECTD3Q5T447 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HECTD3Q5T447 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HECTD3Q5T447 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HECTD3Q5T447 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HECTD3Q5T447 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HECTD3Q5T447 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HECTD3Q5T447 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HECTD3Q5T447 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HECTD3Q5T447 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HECTD3Q5T447 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HECTD3Q5T447 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HECTD3Q5T447 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HECTD3Q5T447 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HECTD3Q5T447 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HECTD3Q5T447 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HECTD3Q5T447 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HECTD3Q5T447 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HECTD3Q5T447 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HECTD3Q5T447 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HECTD3Q5T447 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HECTD3Q5T447 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HECTD3Q5T447 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HECTD3Q5T447 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HECTD3Q5T447 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HECTD3Q5T447 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HECTD3Q5T447 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HECTD3Q5T447 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HECTD3Q5T447 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HECTD3Q5T447 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HECTD3Q5T447 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HECTD3Q5T447 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HECTD3Q5T447 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HECTD3Q5T447 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HECTD3Q5T447 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HECTD3Q5T447 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HECTD3Q5T447 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HECTD3Q5T447 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HECTD3Q5T447 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HECTD3Q5T447 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HECTD3Q5T447 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HECTD3Q5T447 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HECTD3Q5T447 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HECTD3Q5T447 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HECTD3Q5T447 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HECTD3Q5T447 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HECTD3Q5T447 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HECTD3Q5T447 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HECTD3Q5T447 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HECTD3Q5T447 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECTD3Q5T447 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECTD3Q5T447 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECTD3Q5T447 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECTD3Q5T447 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECTD3Q5T447 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECTD3Q5T447 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECTD3Q5T447 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECTD3Q5T447 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HECTD3Q5T447 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HECTD3Q5T447 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HECTD3Q5T447 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HECTD3Q5T447 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HECTD3Q5T447 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HECTD3Q5T447 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HECTD3Q5T447 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HECTD3Q5T447 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HECTD3Q5T447 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HECTD3Q5T447 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HECTD3Q5T447 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HECTD3Q5T447 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HECTD3Q5T447 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HECTD3Q5T447 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HECTD3Q5T447 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HECTD3Q5T447 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HECTD3Q5T447 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HECTD3Q5T447 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HECTD3Q5T447 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HECTD3Q5T447 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HECTD3Q5T447 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HECTD3Q5T447 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HECTD3Q5T447 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HECTD3Q5T447 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HECTD3Q5T447 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HECTD3Q5T447 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HECTD3Q5T447 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HECTD3Q5T447 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HECTD3Q5T447 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECTD3Q5T447 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECTD3Q5T447 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECTD3Q5T447 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECTD3Q5T447 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECTD3Q5T447 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECTD3Q5T447 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HECTD3Q5T447 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HECTD3Q5T447 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HECTD3Q5T447 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HECTD3Q5T447 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HECTD3Q5T447 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HECTD3Q5T447 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HECTD3Q5T447 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms