Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL5A1-AS1Q5SY13 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms