Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAPCD1Q5SSQ6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAPCD1Q5SSQ6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SAPCD1Q5SSQ6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAPCD1Q5SSQ6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAPCD1Q5SSQ6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAPCD1Q5SSQ6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAPCD1Q5SSQ6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAPCD1Q5SSQ6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAPCD1Q5SSQ6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAPCD1Q5SSQ6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAPCD1Q5SSQ6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAPCD1Q5SSQ6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAPCD1Q5SSQ6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SAPCD1Q5SSQ6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAPCD1Q5SSQ6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAPCD1Q5SSQ6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAPCD1Q5SSQ6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAPCD1Q5SSQ6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAPCD1Q5SSQ6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAPCD1Q5SSQ6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAPCD1Q5SSQ6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAPCD1Q5SSQ6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAPCD1Q5SSQ6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAPCD1Q5SSQ6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms