Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HP1BP3Q5SSJ5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HP1BP3Q5SSJ5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HP1BP3Q5SSJ5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HP1BP3Q5SSJ5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HP1BP3Q5SSJ5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HP1BP3Q5SSJ5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HP1BP3Q5SSJ5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HP1BP3Q5SSJ5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HP1BP3Q5SSJ5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HP1BP3Q5SSJ5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HP1BP3Q5SSJ5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HP1BP3Q5SSJ5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HP1BP3Q5SSJ5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HP1BP3Q5SSJ5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HP1BP3Q5SSJ5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HP1BP3Q5SSJ5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HP1BP3Q5SSJ5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HP1BP3Q5SSJ5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HP1BP3Q5SSJ5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HP1BP3Q5SSJ5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HP1BP3Q5SSJ5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HP1BP3Q5SSJ5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HP1BP3Q5SSJ5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HP1BP3Q5SSJ5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.68
HP1BP3Q5SSJ5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HP1BP3Q5SSJ5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HP1BP3Q5SSJ5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HP1BP3Q5SSJ5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HP1BP3Q5SSJ5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HP1BP3Q5SSJ5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HP1BP3Q5SSJ5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HP1BP3Q5SSJ5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HP1BP3Q5SSJ5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HP1BP3Q5SSJ5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HP1BP3Q5SSJ5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HP1BP3Q5SSJ5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HP1BP3Q5SSJ5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HP1BP3Q5SSJ5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HP1BP3Q5SSJ5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HP1BP3Q5SSJ5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HP1BP3Q5SSJ5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HP1BP3Q5SSJ5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HP1BP3Q5SSJ5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HP1BP3Q5SSJ5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HP1BP3Q5SSJ5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HP1BP3Q5SSJ5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HP1BP3Q5SSJ5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HP1BP3Q5SSJ5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HP1BP3Q5SSJ5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HP1BP3Q5SSJ5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HP1BP3Q5SSJ5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HP1BP3Q5SSJ5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HP1BP3Q5SSJ5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HP1BP3Q5SSJ5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HP1BP3Q5SSJ5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HP1BP3Q5SSJ5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HP1BP3Q5SSJ5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HP1BP3Q5SSJ5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HP1BP3Q5SSJ5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HP1BP3Q5SSJ5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HP1BP3Q5SSJ5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HP1BP3Q5SSJ5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HP1BP3Q5SSJ5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HP1BP3Q5SSJ5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HP1BP3Q5SSJ5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HP1BP3Q5SSJ5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms