Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQN1

SNAP47, Synaptosomal-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP47Q5SQN1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP47Q5SQN1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP47Q5SQN1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP47Q5SQN1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP47Q5SQN1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP47Q5SQN1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP47Q5SQN1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP47Q5SQN1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP47Q5SQN1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP47Q5SQN1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP47Q5SQN1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP47Q5SQN1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP47Q5SQN1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP47Q5SQN1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP47Q5SQN1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP47Q5SQN1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP47Q5SQN1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP47Q5SQN1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP47Q5SQN1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP47Q5SQN1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP47Q5SQN1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP47Q5SQN1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP47Q5SQN1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNAP47Q5SQN1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP47Q5SQN1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP47Q5SQN1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP47Q5SQN1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP47Q5SQN1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP47Q5SQN1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP47Q5SQN1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP47Q5SQN1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP47Q5SQN1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP47Q5SQN1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP47Q5SQN1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP47Q5SQN1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP47Q5SQN1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP47Q5SQN1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP47Q5SQN1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP47Q5SQN1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP47Q5SQN1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP47Q5SQN1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP47Q5SQN1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP47Q5SQN1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP47Q5SQN1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNAP47Q5SQN1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNAP47Q5SQN1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNAP47Q5SQN1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNAP47Q5SQN1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNAP47Q5SQN1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNAP47Q5SQN1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNAP47Q5SQN1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNAP47Q5SQN1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNAP47Q5SQN1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNAP47Q5SQN1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNAP47Q5SQN1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNAP47Q5SQN1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAP47Q5SQN1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAP47Q5SQN1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAP47Q5SQN1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAP47Q5SQN1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNAP47Q5SQN1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNAP47Q5SQN1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNAP47Q5SQN1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNAP47Q5SQN1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SNAP47Q5SQN1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNAP47Q5SQN1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNAP47Q5SQN1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNAP47Q5SQN1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNAP47Q5SQN1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms