Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBN2

TRIM61, Putative tripartite motif-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM61Q5EBN2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM61Q5EBN2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM61Q5EBN2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM61Q5EBN2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM61Q5EBN2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM61Q5EBN2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM61Q5EBN2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM61Q5EBN2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM61Q5EBN2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM61Q5EBN2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM61Q5EBN2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM61Q5EBN2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM61Q5EBN2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM61Q5EBN2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM61Q5EBN2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM61Q5EBN2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM61Q5EBN2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM61Q5EBN2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM61Q5EBN2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM61Q5EBN2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM61Q5EBN2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM61Q5EBN2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM61Q5EBN2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM61Q5EBN2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM61Q5EBN2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM61Q5EBN2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM61Q5EBN2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM61Q5EBN2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM61Q5EBN2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM61Q5EBN2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM61Q5EBN2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM61Q5EBN2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM61Q5EBN2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM61Q5EBN2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM61Q5EBN2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM61Q5EBN2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM61Q5EBN2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM61Q5EBN2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM61Q5EBN2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM61Q5EBN2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM61Q5EBN2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM61Q5EBN2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM61Q5EBN2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM61Q5EBN2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM61Q5EBN2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM61Q5EBN2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM61Q5EBN2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM61Q5EBN2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM61Q5EBN2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM61Q5EBN2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM61Q5EBN2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM61Q5EBN2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM61Q5EBN2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM61Q5EBN2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM61Q5EBN2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM61Q5EBN2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM61Q5EBN2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM61Q5EBN2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM61Q5EBN2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM61Q5EBN2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM61Q5EBN2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM61Q5EBN2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM61Q5EBN2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM61Q5EBN2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM61Q5EBN2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM61Q5EBN2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM61Q5EBN2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM61Q5EBN2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM61Q5EBN2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM61Q5EBN2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM61Q5EBN2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM61Q5EBN2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM61Q5EBN2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM61Q5EBN2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM61Q5EBN2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM61Q5EBN2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM61Q5EBN2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM61Q5EBN2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM61Q5EBN2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM61Q5EBN2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM61Q5EBN2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM61Q5EBN2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM61Q5EBN2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM61Q5EBN2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM61Q5EBN2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM61Q5EBN2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM61Q5EBN2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM61Q5EBN2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM61Q5EBN2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM61Q5EBN2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM61Q5EBN2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms