Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf116Q5BN46 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf116Q5BN46 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C9orf116Q5BN46 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms