Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ESCO2Q56NI9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ESCO2Q56NI9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESCO2Q56NI9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESCO2Q56NI9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ESCO2Q56NI9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ESCO2Q56NI9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ESCO2Q56NI9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ESCO2Q56NI9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ESCO2Q56NI9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ESCO2Q56NI9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ESCO2Q56NI9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ESCO2Q56NI9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ESCO2Q56NI9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ESCO2Q56NI9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ESCO2Q56NI9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ESCO2Q56NI9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ESCO2Q56NI9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ESCO2Q56NI9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ESCO2Q56NI9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ESCO2Q56NI9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ESCO2Q56NI9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ESCO2Q56NI9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ESCO2Q56NI9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ESCO2Q56NI9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ESCO2Q56NI9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ESCO2Q56NI9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
ESCO2Q56NI9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ESCO2Q56NI9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ESCO2Q56NI9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ESCO2Q56NI9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ESCO2Q56NI9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ESCO2Q56NI9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ESCO2Q56NI9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ESCO2Q56NI9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ESCO2Q56NI9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ESCO2Q56NI9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ESCO2Q56NI9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ESCO2Q56NI9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ESCO2Q56NI9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ESCO2Q56NI9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ESCO2Q56NI9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ESCO2Q56NI9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ESCO2Q56NI9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ESCO2Q56NI9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ESCO2Q56NI9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ESCO2Q56NI9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ESCO2Q56NI9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ESCO2Q56NI9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ESCO2Q56NI9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ESCO2Q56NI9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ESCO2Q56NI9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ESCO2Q56NI9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ESCO2Q56NI9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ESCO2Q56NI9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ESCO2Q56NI9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ESCO2Q56NI9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ESCO2Q56NI9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ESCO2Q56NI9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ESCO2Q56NI9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ESCO2Q56NI9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ESCO2Q56NI9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ESCO2Q56NI9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ESCO2Q56NI9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ESCO2Q56NI9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ESCO2Q56NI9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ESCO2Q56NI9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ESCO2Q56NI9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ESCO2Q56NI9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ESCO2Q56NI9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ESCO2Q56NI9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ESCO2Q56NI9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ESCO2Q56NI9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ESCO2Q56NI9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ESCO2Q56NI9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ESCO2Q56NI9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ESCO2Q56NI9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ESCO2Q56NI9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ESCO2Q56NI9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ESCO2Q56NI9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ESCO2Q56NI9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ESCO2Q56NI9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ESCO2Q56NI9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ESCO2Q56NI9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ESCO2Q56NI9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ESCO2Q56NI9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ESCO2Q56NI9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ESCO2Q56NI9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ESCO2Q56NI9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ESCO2Q56NI9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ESCO2Q56NI9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ESCO2Q56NI9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ESCO2Q56NI9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ESCO2Q56NI9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ESCO2Q56NI9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms