Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GREB1Q4ZG55 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GREB1Q4ZG55 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GREB1Q4ZG55 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GREB1Q4ZG55 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GREB1Q4ZG55 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GREB1Q4ZG55 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GREB1Q4ZG55 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
GREB1Q4ZG55 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GREB1Q4ZG55 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GREB1Q4ZG55 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GREB1Q4ZG55 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GREB1Q4ZG55 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GREB1Q4ZG55 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GREB1Q4ZG55 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GREB1Q4ZG55 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GREB1Q4ZG55 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GREB1Q4ZG55 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GREB1Q4ZG55 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GREB1Q4ZG55 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GREB1Q4ZG55 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GREB1Q4ZG55 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GREB1Q4ZG55 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GREB1Q4ZG55 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GREB1Q4ZG55 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GREB1Q4ZG55 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GREB1Q4ZG55 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GREB1Q4ZG55 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GREB1Q4ZG55 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GREB1Q4ZG55 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GREB1Q4ZG55 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GREB1Q4ZG55 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GREB1Q4ZG55 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GREB1Q4ZG55 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GREB1Q4ZG55 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms