Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SVEP1Q4LDE5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SVEP1Q4LDE5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SVEP1Q4LDE5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SVEP1Q4LDE5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SVEP1Q4LDE5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SVEP1Q4LDE5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SVEP1Q4LDE5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SVEP1Q4LDE5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SVEP1Q4LDE5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SVEP1Q4LDE5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SVEP1Q4LDE5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SVEP1Q4LDE5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SVEP1Q4LDE5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SVEP1Q4LDE5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SVEP1Q4LDE5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SVEP1Q4LDE5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SVEP1Q4LDE5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SVEP1Q4LDE5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SVEP1Q4LDE5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SVEP1Q4LDE5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SVEP1Q4LDE5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SVEP1Q4LDE5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SVEP1Q4LDE5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SVEP1Q4LDE5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SVEP1Q4LDE5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SVEP1Q4LDE5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SVEP1Q4LDE5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SVEP1Q4LDE5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SVEP1Q4LDE5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SVEP1Q4LDE5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms