Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMG9

TMEM52B, Transmembrane protein 52B, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM52BQ4KMG9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM52BQ4KMG9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM52BQ4KMG9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM52BQ4KMG9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM52BQ4KMG9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM52BQ4KMG9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM52BQ4KMG9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM52BQ4KMG9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM52BQ4KMG9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM52BQ4KMG9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM52BQ4KMG9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM52BQ4KMG9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMEM52BQ4KMG9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM52BQ4KMG9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM52BQ4KMG9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms