Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBS9Q3SYG4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBS9Q3SYG4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BBS9Q3SYG4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BBS9Q3SYG4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBS9Q3SYG4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBS9Q3SYG4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BBS9Q3SYG4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBS9Q3SYG4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBS9Q3SYG4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBS9Q3SYG4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBS9Q3SYG4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBS9Q3SYG4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBS9Q3SYG4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BBS9Q3SYG4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BBS9Q3SYG4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BBS9Q3SYG4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BBS9Q3SYG4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BBS9Q3SYG4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BBS9Q3SYG4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BBS9Q3SYG4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BBS9Q3SYG4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BBS9Q3SYG4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BBS9Q3SYG4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BBS9Q3SYG4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BBS9Q3SYG4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BBS9Q3SYG4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBS9Q3SYG4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBS9Q3SYG4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBS9Q3SYG4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBS9Q3SYG4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBS9Q3SYG4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBS9Q3SYG4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BBS9Q3SYG4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BBS9Q3SYG4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BBS9Q3SYG4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BBS9Q3SYG4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BBS9Q3SYG4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BBS9Q3SYG4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BBS9Q3SYG4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BBS9Q3SYG4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BBS9Q3SYG4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BBS9Q3SYG4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BBS9Q3SYG4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BBS9Q3SYG4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BBS9Q3SYG4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BBS9Q3SYG4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BBS9Q3SYG4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BBS9Q3SYG4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BBS9Q3SYG4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BBS9Q3SYG4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BBS9Q3SYG4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BBS9Q3SYG4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BBS9Q3SYG4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BBS9Q3SYG4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BBS9Q3SYG4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BBS9Q3SYG4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BBS9Q3SYG4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BBS9Q3SYG4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BBS9Q3SYG4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BBS9Q3SYG4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BBS9Q3SYG4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BBS9Q3SYG4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BBS9Q3SYG4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BBS9Q3SYG4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BBS9Q3SYG4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BBS9Q3SYG4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BBS9Q3SYG4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BBS9Q3SYG4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BBS9Q3SYG4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BBS9Q3SYG4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BBS9Q3SYG4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBS9Q3SYG4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBS9Q3SYG4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBS9Q3SYG4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBS9Q3SYG4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BBS9Q3SYG4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BBS9Q3SYG4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BBS9Q3SYG4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BBS9Q3SYG4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBS9Q3SYG4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBS9Q3SYG4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBS9Q3SYG4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBS9Q3SYG4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBS9Q3SYG4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms