Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00303Q3SY05 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00303Q3SY05 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00303Q3SY05 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00303Q3SY05 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00303Q3SY05 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00303Q3SY05 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00303Q3SY05 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00303Q3SY05 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00303Q3SY05 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00303Q3SY05 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00303Q3SY05 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00303Q3SY05 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00303Q3SY05 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00303Q3SY05 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00303Q3SY05 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00303Q3SY05 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00303Q3SY05 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00303Q3SY05 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00303Q3SY05 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00303Q3SY05 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00303Q3SY05 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00303Q3SY05 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00303Q3SY05 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00303Q3SY05 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00303Q3SY05 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00303Q3SY05 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.4 ms