Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP41Q3LFD5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP41Q3LFD5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
USP41Q3LFD5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP41Q3LFD5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP41Q3LFD5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP41Q3LFD5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
USP41Q3LFD5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP41Q3LFD5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP41Q3LFD5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP41Q3LFD5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP41Q3LFD5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP41Q3LFD5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP41Q3LFD5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP41Q3LFD5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP41Q3LFD5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP41Q3LFD5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP41Q3LFD5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP41Q3LFD5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP41Q3LFD5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP41Q3LFD5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
USP41Q3LFD5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
USP41Q3LFD5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
USP41Q3LFD5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP41Q3LFD5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP41Q3LFD5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP41Q3LFD5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP41Q3LFD5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP41Q3LFD5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP41Q3LFD5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP41Q3LFD5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP41Q3LFD5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP41Q3LFD5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP41Q3LFD5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP41Q3LFD5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP41Q3LFD5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP41Q3LFD5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
USP41Q3LFD5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP41Q3LFD5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP41Q3LFD5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP41Q3LFD5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
USP41Q3LFD5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP41Q3LFD5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP41Q3LFD5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP41Q3LFD5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP41Q3LFD5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP41Q3LFD5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
USP41Q3LFD5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
USP41Q3LFD5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP41Q3LFD5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
USP41Q3LFD5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP41Q3LFD5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP41Q3LFD5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP41Q3LFD5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP41Q3LFD5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP41Q3LFD5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP41Q3LFD5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP41Q3LFD5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
USP41Q3LFD5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP41Q3LFD5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP41Q3LFD5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP41Q3LFD5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP41Q3LFD5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP41Q3LFD5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP41Q3LFD5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP41Q3LFD5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP41Q3LFD5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP41Q3LFD5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
USP41Q3LFD5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP41Q3LFD5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP41Q3LFD5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms