Protein–RNA interactions for Protein: Q16763

UBE2S, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 S, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2SQ16763 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBE2SQ16763 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBE2SQ16763 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBE2SQ16763 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBE2SQ16763 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE2SQ16763 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE2SQ16763 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE2SQ16763 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBE2SQ16763 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBE2SQ16763 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBE2SQ16763 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBE2SQ16763 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBE2SQ16763 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBE2SQ16763 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBE2SQ16763 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
UBE2SQ16763 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBE2SQ16763 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBE2SQ16763 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBE2SQ16763 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBE2SQ16763 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBE2SQ16763 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBE2SQ16763 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
UBE2SQ16763 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBE2SQ16763 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
UBE2SQ16763 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE2SQ16763 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE2SQ16763 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE2SQ16763 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE2SQ16763 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE2SQ16763 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE2SQ16763 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE2SQ16763 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE2SQ16763 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE2SQ16763 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE2SQ16763 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE2SQ16763 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBE2SQ16763 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBE2SQ16763 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBE2SQ16763 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBE2SQ16763 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBE2SQ16763 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBE2SQ16763 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBE2SQ16763 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBE2SQ16763 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBE2SQ16763 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBE2SQ16763 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBE2SQ16763 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBE2SQ16763 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
UBE2SQ16763 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBE2SQ16763 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBE2SQ16763 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBE2SQ16763 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
UBE2SQ16763 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBE2SQ16763 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBE2SQ16763 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBE2SQ16763 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBE2SQ16763 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBE2SQ16763 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBE2SQ16763 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBE2SQ16763 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBE2SQ16763 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE2SQ16763 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE2SQ16763 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE2SQ16763 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE2SQ16763 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE2SQ16763 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBE2SQ16763 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBE2SQ16763 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBE2SQ16763 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
UBE2SQ16763 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
UBE2SQ16763 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms