Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTGISQ16647 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTGISQ16647 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTGISQ16647 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTGISQ16647 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTGISQ16647 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTGISQ16647 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTGISQ16647 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTGISQ16647 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTGISQ16647 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTGISQ16647 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTGISQ16647 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTGISQ16647 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTGISQ16647 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTGISQ16647 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTGISQ16647 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTGISQ16647 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTGISQ16647 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTGISQ16647 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTGISQ16647 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTGISQ16647 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTGISQ16647 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTGISQ16647 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTGISQ16647 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTGISQ16647 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTGISQ16647 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PTGISQ16647 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTGISQ16647 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGISQ16647 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGISQ16647 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGISQ16647 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTGISQ16647 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTGISQ16647 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTGISQ16647 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTGISQ16647 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTGISQ16647 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTGISQ16647 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PTGISQ16647 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTGISQ16647 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTGISQ16647 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTGISQ16647 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTGISQ16647 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTGISQ16647 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTGISQ16647 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTGISQ16647 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTGISQ16647 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTGISQ16647 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTGISQ16647 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTGISQ16647 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTGISQ16647 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTGISQ16647 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTGISQ16647 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTGISQ16647 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTGISQ16647 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTGISQ16647 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTGISQ16647 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTGISQ16647 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTGISQ16647 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTGISQ16647 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTGISQ16647 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PTGISQ16647 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTGISQ16647 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTGISQ16647 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PTGISQ16647 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTGISQ16647 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTGISQ16647 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTGISQ16647 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTGISQ16647 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PTGISQ16647 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTGISQ16647 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTGISQ16647 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTGISQ16647 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTGISQ16647 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTGISQ16647 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTGISQ16647 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTGISQ16647 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PTGISQ16647 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PTGISQ16647 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTGISQ16647 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PTGISQ16647 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PTGISQ16647 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PTGISQ16647 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTGISQ16647 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTGISQ16647 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTGISQ16647 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTGISQ16647 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PTGISQ16647 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTGISQ16647 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTGISQ16647 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTGISQ16647 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTGISQ16647 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTGISQ16647 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTGISQ16647 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTGISQ16647 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTGISQ16647 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTGISQ16647 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTGISQ16647 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTGISQ16647 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms