Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGCAQ16586 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGCAQ16586 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGCAQ16586 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGCAQ16586 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCAQ16586 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCAQ16586 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCAQ16586 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCAQ16586 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCAQ16586 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCAQ16586 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCAQ16586 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCAQ16586 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCAQ16586 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCAQ16586 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCAQ16586 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCAQ16586 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCAQ16586 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCAQ16586 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCAQ16586 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCAQ16586 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCAQ16586 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCAQ16586 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCAQ16586 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCAQ16586 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCAQ16586 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCAQ16586 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCAQ16586 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCAQ16586 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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