Protein–RNA interactions for Protein: Q15714

TSC22D1, TSC22 domain family protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D1Q15714 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSC22D1Q15714 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSC22D1Q15714 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSC22D1Q15714 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSC22D1Q15714 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSC22D1Q15714 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSC22D1Q15714 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSC22D1Q15714 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSC22D1Q15714 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSC22D1Q15714 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSC22D1Q15714 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSC22D1Q15714 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSC22D1Q15714 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSC22D1Q15714 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC22D1Q15714 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC22D1Q15714 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC22D1Q15714 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC22D1Q15714 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSC22D1Q15714 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC22D1Q15714 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC22D1Q15714 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC22D1Q15714 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC22D1Q15714 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC22D1Q15714 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC22D1Q15714 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC22D1Q15714 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC22D1Q15714 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC22D1Q15714 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TSC22D1Q15714 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TSC22D1Q15714 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC22D1Q15714 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms