Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDSNQ15517 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDSNQ15517 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDSNQ15517 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDSNQ15517 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDSNQ15517 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDSNQ15517 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDSNQ15517 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDSNQ15517 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDSNQ15517 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDSNQ15517 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDSNQ15517 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDSNQ15517 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDSNQ15517 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDSNQ15517 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDSNQ15517 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDSNQ15517 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDSNQ15517 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDSNQ15517 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDSNQ15517 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDSNQ15517 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDSNQ15517 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDSNQ15517 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDSNQ15517 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDSNQ15517 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDSNQ15517 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDSNQ15517 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDSNQ15517 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDSNQ15517 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDSNQ15517 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDSNQ15517 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDSNQ15517 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDSNQ15517 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDSNQ15517 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDSNQ15517 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDSNQ15517 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDSNQ15517 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDSNQ15517 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDSNQ15517 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDSNQ15517 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDSNQ15517 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDSNQ15517 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDSNQ15517 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDSNQ15517 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDSNQ15517 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDSNQ15517 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDSNQ15517 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDSNQ15517 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDSNQ15517 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDSNQ15517 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDSNQ15517 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDSNQ15517 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDSNQ15517 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDSNQ15517 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDSNQ15517 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDSNQ15517 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDSNQ15517 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDSNQ15517 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDSNQ15517 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDSNQ15517 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDSNQ15517 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDSNQ15517 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDSNQ15517 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDSNQ15517 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDSNQ15517 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDSNQ15517 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
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