Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PUM3Q15397 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PUM3Q15397 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PUM3Q15397 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
PUM3Q15397 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PUM3Q15397 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PUM3Q15397 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PUM3Q15397 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
PUM3Q15397 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PUM3Q15397 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PUM3Q15397 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PUM3Q15397 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PUM3Q15397 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PUM3Q15397 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PUM3Q15397 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PUM3Q15397 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PUM3Q15397 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PUM3Q15397 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PUM3Q15397 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PUM3Q15397 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PUM3Q15397 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
PUM3Q15397 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PUM3Q15397 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PUM3Q15397 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PUM3Q15397 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PUM3Q15397 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PUM3Q15397 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PUM3Q15397 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PUM3Q15397 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PUM3Q15397 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PUM3Q15397 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PUM3Q15397 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PUM3Q15397 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PUM3Q15397 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PUM3Q15397 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PUM3Q15397 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PUM3Q15397 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PUM3Q15397 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PUM3Q15397 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PUM3Q15397 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PUM3Q15397 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PUM3Q15397 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PUM3Q15397 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PUM3Q15397 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PUM3Q15397 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PUM3Q15397 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PUM3Q15397 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
PUM3Q15397 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PUM3Q15397 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
PUM3Q15397 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PUM3Q15397 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PUM3Q15397 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PUM3Q15397 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PUM3Q15397 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PUM3Q15397 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PUM3Q15397 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PUM3Q15397 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PUM3Q15397 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PUM3Q15397 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PUM3Q15397 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PUM3Q15397 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PUM3Q15397 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PUM3Q15397 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PUM3Q15397 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PUM3Q15397 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PUM3Q15397 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PUM3Q15397 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PUM3Q15397 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PUM3Q15397 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PUM3Q15397 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
PUM3Q15397 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
PUM3Q15397 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PUM3Q15397 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PUM3Q15397 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PUM3Q15397 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PUM3Q15397 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PUM3Q15397 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PUM3Q15397 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PUM3Q15397 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PUM3Q15397 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PUM3Q15397 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PUM3Q15397 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PUM3Q15397 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PUM3Q15397 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PUM3Q15397 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
PUM3Q15397 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PUM3Q15397 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PUM3Q15397 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
PUM3Q15397 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PUM3Q15397 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PUM3Q15397 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PUM3Q15397 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PUM3Q15397 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PUM3Q15397 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PUM3Q15397 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PUM3Q15397 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PUM3Q15397 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PUM3Q15397 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PUM3Q15397 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PUM3Q15397 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
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