Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TTF1Q15361 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TTF1Q15361 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TTF1Q15361 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TTF1Q15361 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TTF1Q15361 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TTF1Q15361 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TTF1Q15361 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TTF1Q15361 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TTF1Q15361 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TTF1Q15361 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TTF1Q15361 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TTF1Q15361 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TTF1Q15361 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TTF1Q15361 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TTF1Q15361 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TTF1Q15361 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TTF1Q15361 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TTF1Q15361 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TTF1Q15361 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TTF1Q15361 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TTF1Q15361 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TTF1Q15361 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TTF1Q15361 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TTF1Q15361 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TTF1Q15361 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TTF1Q15361 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
TTF1Q15361 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
TTF1Q15361 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TTF1Q15361 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TTF1Q15361 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TTF1Q15361 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TTF1Q15361 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TTF1Q15361 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TTF1Q15361 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TTF1Q15361 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TTF1Q15361 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TTF1Q15361 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TTF1Q15361 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TTF1Q15361 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TTF1Q15361 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TTF1Q15361 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TTF1Q15361 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TTF1Q15361 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
TTF1Q15361 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TTF1Q15361 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
TTF1Q15361 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TTF1Q15361 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TTF1Q15361 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TTF1Q15361 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TTF1Q15361 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TTF1Q15361 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TTF1Q15361 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TTF1Q15361 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TTF1Q15361 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TTF1Q15361 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TTF1Q15361 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TTF1Q15361 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TTF1Q15361 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TTF1Q15361 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TTF1Q15361 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TTF1Q15361 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TTF1Q15361 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TTF1Q15361 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TTF1Q15361 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TTF1Q15361 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TTF1Q15361 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TTF1Q15361 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TTF1Q15361 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TTF1Q15361 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TTF1Q15361 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TTF1Q15361 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TTF1Q15361 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TTF1Q15361 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TTF1Q15361 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TTF1Q15361 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TTF1Q15361 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TTF1Q15361 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TTF1Q15361 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TTF1Q15361 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
TTF1Q15361 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TTF1Q15361 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TTF1Q15361 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TTF1Q15361 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TTF1Q15361 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TTF1Q15361 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
TTF1Q15361 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TTF1Q15361 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TTF1Q15361 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TTF1Q15361 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TTF1Q15361 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
TTF1Q15361 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TTF1Q15361 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TTF1Q15361 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TTF1Q15361 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TTF1Q15361 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TTF1Q15361 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TTF1Q15361 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TTF1Q15361 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TTF1Q15361 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
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