Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCOLCEQ15113 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCOLCEQ15113 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCOLCEQ15113 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCOLCEQ15113 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCOLCEQ15113 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCOLCEQ15113 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCOLCEQ15113 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCOLCEQ15113 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCOLCEQ15113 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCOLCEQ15113 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCOLCEQ15113 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCOLCEQ15113 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCOLCEQ15113 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCOLCEQ15113 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCOLCEQ15113 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCOLCEQ15113 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCOLCEQ15113 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCOLCEQ15113 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCOLCEQ15113 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCOLCEQ15113 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCOLCEQ15113 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCOLCEQ15113 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCOLCEQ15113 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCOLCEQ15113 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCOLCEQ15113 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCOLCEQ15113 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCOLCEQ15113 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCOLCEQ15113 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCOLCEQ15113 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCOLCEQ15113 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCOLCEQ15113 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCOLCEQ15113 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCOLCEQ15113 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCOLCEQ15113 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCOLCEQ15113 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCOLCEQ15113 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCOLCEQ15113 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCOLCEQ15113 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCOLCEQ15113 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCOLCEQ15113 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCOLCEQ15113 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCOLCEQ15113 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCOLCEQ15113 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCOLCEQ15113 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCOLCEQ15113 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCOLCEQ15113 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCOLCEQ15113 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCOLCEQ15113 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCOLCEQ15113 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCOLCEQ15113 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
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