Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCAPHQ15003 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCAPHQ15003 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCAPHQ15003 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCAPHQ15003 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCAPHQ15003 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCAPHQ15003 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCAPHQ15003 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCAPHQ15003 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCAPHQ15003 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCAPHQ15003 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NCAPHQ15003 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCAPHQ15003 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCAPHQ15003 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCAPHQ15003 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCAPHQ15003 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCAPHQ15003 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCAPHQ15003 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCAPHQ15003 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCAPHQ15003 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCAPHQ15003 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NCAPHQ15003 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NCAPHQ15003 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NCAPHQ15003 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCAPHQ15003 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCAPHQ15003 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCAPHQ15003 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCAPHQ15003 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCAPHQ15003 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NCAPHQ15003 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NCAPHQ15003 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCAPHQ15003 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCAPHQ15003 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCAPHQ15003 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCAPHQ15003 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCAPHQ15003 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCAPHQ15003 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCAPHQ15003 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCAPHQ15003 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCAPHQ15003 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCAPHQ15003 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCAPHQ15003 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCAPHQ15003 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCAPHQ15003 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCAPHQ15003 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCAPHQ15003 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCAPHQ15003 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCAPHQ15003 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NCAPHQ15003 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCAPHQ15003 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCAPHQ15003 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NCAPHQ15003 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCAPHQ15003 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCAPHQ15003 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCAPHQ15003 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCAPHQ15003 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NCAPHQ15003 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCAPHQ15003 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCAPHQ15003 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCAPHQ15003 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCAPHQ15003 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCAPHQ15003 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCAPHQ15003 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCAPHQ15003 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCAPHQ15003 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCAPHQ15003 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPHQ15003 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCAPHQ15003 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPHQ15003 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPHQ15003 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPHQ15003 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPHQ15003 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPHQ15003 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCAPHQ15003 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NCAPHQ15003 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCAPHQ15003 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCAPHQ15003 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NCAPHQ15003 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCAPHQ15003 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCAPHQ15003 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCAPHQ15003 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCAPHQ15003 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCAPHQ15003 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCAPHQ15003 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCAPHQ15003 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCAPHQ15003 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCAPHQ15003 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAPHQ15003 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAPHQ15003 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAPHQ15003 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCAPHQ15003 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCAPHQ15003 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCAPHQ15003 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCAPHQ15003 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCAPHQ15003 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NCAPHQ15003 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCAPHQ15003 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCAPHQ15003 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCAPHQ15003 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NCAPHQ15003 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
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