Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CBX2Q14781 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CBX2Q14781 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CBX2Q14781 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CBX2Q14781 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CBX2Q14781 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CBX2Q14781 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CBX2Q14781 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CBX2Q14781 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CBX2Q14781 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CBX2Q14781 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CBX2Q14781 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CBX2Q14781 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CBX2Q14781 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CBX2Q14781 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CBX2Q14781 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CBX2Q14781 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CBX2Q14781 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CBX2Q14781 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CBX2Q14781 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CBX2Q14781 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CBX2Q14781 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CBX2Q14781 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CBX2Q14781 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CBX2Q14781 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CBX2Q14781 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CBX2Q14781 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CBX2Q14781 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CBX2Q14781 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CBX2Q14781 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CBX2Q14781 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CBX2Q14781 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CBX2Q14781 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CBX2Q14781 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CBX2Q14781 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CBX2Q14781 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CBX2Q14781 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CBX2Q14781 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms