Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTAN1Q13813 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTAN1Q13813 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTAN1Q13813 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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