Protein–RNA interactions for Protein: Q13613

MTMR1, Myotubularin-related protein 1, humanhuman

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1Q13613 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MTMR1Q13613 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MTMR1Q13613 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MTMR1Q13613 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MTMR1Q13613 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MTMR1Q13613 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MTMR1Q13613 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MTMR1Q13613 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MTMR1Q13613 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MTMR1Q13613 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MTMR1Q13613 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MTMR1Q13613 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MTMR1Q13613 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MTMR1Q13613 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTMR1Q13613 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MTMR1Q13613 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MTMR1Q13613 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MTMR1Q13613 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MTMR1Q13613 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MTMR1Q13613 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
MTMR1Q13613 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MTMR1Q13613 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MTMR1Q13613 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MTMR1Q13613 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MTMR1Q13613 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTMR1Q13613 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MTMR1Q13613 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTMR1Q13613 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTMR1Q13613 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MTMR1Q13613 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTMR1Q13613 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTMR1Q13613 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTMR1Q13613 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTMR1Q13613 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTMR1Q13613 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTMR1Q13613 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTMR1Q13613 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTMR1Q13613 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTMR1Q13613 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTMR1Q13613 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTMR1Q13613 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTMR1Q13613 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTMR1Q13613 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MTMR1Q13613 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTMR1Q13613 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTMR1Q13613 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTMR1Q13613 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTMR1Q13613 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTMR1Q13613 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MTMR1Q13613 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTMR1Q13613 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTMR1Q13613 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTMR1Q13613 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTMR1Q13613 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTMR1Q13613 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTMR1Q13613 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTMR1Q13613 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTMR1Q13613 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTMR1Q13613 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTMR1Q13613 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTMR1Q13613 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MTMR1Q13613 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTMR1Q13613 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTMR1Q13613 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTMR1Q13613 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MTMR1Q13613 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTMR1Q13613 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTMR1Q13613 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTMR1Q13613 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MTMR1Q13613 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTMR1Q13613 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
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