Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNASE1L3Q13609 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNASE1L3Q13609 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNASE1L3Q13609 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNASE1L3Q13609 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNASE1L3Q13609 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNASE1L3Q13609 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNASE1L3Q13609 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNASE1L3Q13609 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNASE1L3Q13609 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNASE1L3Q13609 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DNASE1L3Q13609 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNASE1L3Q13609 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNASE1L3Q13609 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNASE1L3Q13609 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNASE1L3Q13609 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNASE1L3Q13609 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNASE1L3Q13609 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNASE1L3Q13609 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNASE1L3Q13609 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNASE1L3Q13609 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNASE1L3Q13609 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNASE1L3Q13609 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNASE1L3Q13609 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNASE1L3Q13609 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DNASE1L3Q13609 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNASE1L3Q13609 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNASE1L3Q13609 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
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