Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL49Q13405 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL49Q13405 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MRPL49Q13405 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL49Q13405 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL49Q13405 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL49Q13405 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRPL49Q13405 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL49Q13405 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL49Q13405 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL49Q13405 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRPL49Q13405 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL49Q13405 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL49Q13405 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL49Q13405 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL49Q13405 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MRPL49Q13405 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL49Q13405 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL49Q13405 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL49Q13405 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL49Q13405 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL49Q13405 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL49Q13405 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL49Q13405 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL49Q13405 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL49Q13405 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL49Q13405 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL49Q13405 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL49Q13405 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL49Q13405 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL49Q13405 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL49Q13405 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL49Q13405 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL49Q13405 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL49Q13405 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL49Q13405 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL49Q13405 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL49Q13405 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL49Q13405 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL49Q13405 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL49Q13405 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL49Q13405 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL49Q13405 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL49Q13405 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL49Q13405 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL49Q13405 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL49Q13405 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL49Q13405 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL49Q13405 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL49Q13405 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL49Q13405 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL49Q13405 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL49Q13405 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL49Q13405 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL49Q13405 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL49Q13405 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL49Q13405 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL49Q13405 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL49Q13405 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL49Q13405 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL49Q13405 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL49Q13405 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL49Q13405 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL49Q13405 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL49Q13405 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL49Q13405 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL49Q13405 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL49Q13405 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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