Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 MOB1YIL106W 945 nt7.01□□□□□ -1.29
MSH5Q12175 HMS2YJR147W 1077 nt7.01□□□□□ -1.29
MSH5Q12175 YLL066CYLL066C 3618 nt7□□□□□ -1.29
MSH5Q12175 CDD1YLR245C 429 nt7□□□□□ -1.29
MSH5Q12175 BXI1YNL305C 894 nt7□□□□□ -1.29
MSH5Q12175 YPC1YBR183W 951 nt6.99□□□□□ -1.29
MSH5Q12175 GSH1YJL101C 2037 nt6.99□□□□□ -1.29
MSH5Q12175 ECM38YLR299W 1983 nt6.99□□□□□ -1.29
MSH5Q12175 FUN14YAL008W 597 nt6.98□□□□□ -1.29
MSH5Q12175 OPI11YPR044C 354 nt6.98□□□□□ -1.29
MSH5Q12175 VMA2YBR127C 1554 nt6.98□□□□□ -1.29
MSH5Q12175 TPK1YJL164C 1194 nt6.97□□□□□ -1.29
MSH5Q12175 YJR154WYJR154W 1041 nt6.97□□□□□ -1.29
MSH5Q12175 SNT309YPR101W 528 nt6.97□□□□□ -1.29
MSH5Q12175 GPH1YPR160W 2709 nt6.97□□□□□ -1.29
MSH5Q12175 GLN3YER040W 2193 nt6.96□□□□□ -1.29
MSH5Q12175 BDF2YDL070W 1917 nt6.96□□□□□ -1.3
MSH5Q12175 ERS1YCR075C 783 nt6.96□□□□□ -1.3
MSH5Q12175 YAL045CYAL045C 309 nt6.96□□□□□ -1.3
MSH5Q12175 YBR241CYBR241C 1467 nt6.96□□□□□ -1.3
MSH5Q12175 TAH11YJR046W 1815 nt6.95□□□□□ -1.3
MSH5Q12175 ERG24YNL280C 1317 nt6.95□□□□□ -1.3
MSH5Q12175 ARP3YJR065C 1350 nt6.95□□□□□ -1.3
MSH5Q12175 ARG7YMR062C 1326 nt6.94□□□□□ -1.3
MSH5Q12175 HSP12YFL014W 330 nt6.93□□□□□ -1.3
MSH5Q12175 DAL80YKR034W 810 nt6.93□□□□□ -1.3
MSH5Q12175 NAP1YKR048C 1254 nt6.93□□□□□ -1.3
MSH5Q12175 SUR7YML052W 909 nt6.93□□□□□ -1.3
MSH5Q12175 PRE10YOR362C 867 nt6.93□□□□□ -1.3
MSH5Q12175 AMN1YBR158W 1650 nt6.93□□□□□ -1.3
MSH5Q12175 OCH1YGL038C 1443 nt6.93□□□□□ -1.3
MSH5Q12175 NOG2YNR053C 1461 nt6.92□□□□□ -1.3
MSH5Q12175 YLR280CYLR280C 351 nt6.92□□□□□ -1.3
MSH5Q12175 YHR131CYHR131C 2553 nt6.92□□□□□ -1.3
MSH5Q12175 DAL7YIR031C 1665 nt6.91□□□□□ -1.3
MSH5Q12175 NMD5YJR132W 3147 nt6.91□□□□□ -1.3
MSH5Q12175 IGD1YFR017C 588 nt6.91□□□□□ -1.3
MSH5Q12175 HOG1YLR113W 1308 nt6.91□□□□□ -1.3
MSH5Q12175 CCT3YJL014W 1605 nt6.9□□□□□ -1.31
MSH5Q12175 ASN2YGR124W 1719 nt6.9□□□□□ -1.31
MSH5Q12175 FCY22YER060W-A 1593 nt6.89□□□□□ -1.31
MSH5Q12175 ADE17YMR120C 1779 nt6.89□□□□□ -1.31
MSH5Q12175 PRP2YNR011C 2631 nt6.88□□□□□ -1.31
MSH5Q12175 YOS9YDR057W 1629 nt6.88□□□□□ -1.31
MSH5Q12175 SGE1YPR198W 1632 nt6.88□□□□□ -1.31
MSH5Q12175 TIM50YPL063W 1431 nt6.88□□□□□ -1.31
MSH5Q12175 PHO3YBR092C 1404 nt6.88□□□□□ -1.31
MSH5Q12175 TKL2YBR117C 2046 nt6.88□□□□□ -1.31
MSH5Q12175 YEN1YER041W 2280 nt6.87□□□□□ -1.31
MSH5Q12175 CAK1YFL029C 1107 nt6.87□□□□□ -1.31
MSH5Q12175 HBN1YCL026C-B 582 nt6.87□□□□□ -1.31
MSH5Q12175 CIR2YOR356W 1896 nt6.87□□□□□ -1.31
MSH5Q12175 YPT31YER031C 672 nt6.86□□□□□ -1.31
MSH5Q12175 CPR2YHR057C 618 nt6.86□□□□□ -1.31
MSH5Q12175 SUN4YNL066W 1263 nt6.86□□□□□ -1.31
MSH5Q12175 OPI8YKR035C 642 nt6.85□□□□□ -1.31
MSH5Q12175 CEM1YER061C 1329 nt6.84□□□□□ -1.31
MSH5Q12175 FLX1YIL134W 936 nt6.84□□□□□ -1.31
MSH5Q12175 COX16YJL003W 357 nt6.84□□□□□ -1.31
MSH5Q12175 CYC3YAL039C 810 nt6.84□□□□□ -1.31
MSH5Q12175 SRP102YKL154W 735 nt6.84□□□□□ -1.31
MSH5Q12175 AVT4YNL101W 2142 nt6.84□□□□□ -1.31
MSH5Q12175 YNL200CYNL200C 741 nt6.84□□□□□ -1.31
MSH5Q12175 ERO1YML130C 1692 nt6.83□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 CBK1YNL161W 2271 nt6.83□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 TDP1YBR223C 1635 nt6.83□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 KNS1YLL019C 2214 nt6.82□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 MRPL28YDR462W 444 nt6.82□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 OPI1YHL020C 1215 nt6.82□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 MHP1YJL042W 4197 nt6.81□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 YIP4YGL198W 708 nt6.81□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 YMR166CYMR166C 1107 nt6.81□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 YNR014WYNR014W 639 nt6.81□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 JHD1YER051W 1479 nt6.8□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 MGM101YJR144W 810 nt6.8□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 PHO85YPL031C 918 nt6.8□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 CDC7YDL017W 1524 nt6.8□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 RDR1YOR380W 1641 nt6.79□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt6.79□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt6.79□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt6.79□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt6.79□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt6.79□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt6.79□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt6.79□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt6.79□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt6.79□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt6.79□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt6.79□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 CPD1YGR247W 720 nt6.79□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 CEF1YMR213W 1773 nt6.79□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 HXT2YMR011W 1626 nt6.79□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 VBA5YKR105C 1749 nt6.79□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 YUR1YJL139C 1287 nt6.78□□□□□ -1.32
MSH5Q12175 YML034C-AYML034C-A 399 nt6.77□□□□□ -1.33
MSH5Q12175 LSP1YPL004C 1026 nt6.77□□□□□ -1.33
MSH5Q12175 RPL5YPL131W 894 nt6.77□□□□□ -1.33
MSH5Q12175 YPR127WYPR127W 1038 nt6.77□□□□□ -1.33
MSH5Q12175 ISC1YER019W 1434 nt6.76□□□□□ -1.33
MSH5Q12175 IRC5YFR038W 2562 nt6.76□□□□□ -1.33
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