Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCRN3Q0VDG4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCRN3Q0VDG4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.4 ms