Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LMOD3Q0VAK6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LMOD3Q0VAK6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LMOD3Q0VAK6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LMOD3Q0VAK6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LMOD3Q0VAK6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LMOD3Q0VAK6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
LMOD3Q0VAK6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LMOD3Q0VAK6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LMOD3Q0VAK6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
LMOD3Q0VAK6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
LMOD3Q0VAK6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
LMOD3Q0VAK6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LMOD3Q0VAK6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LMOD3Q0VAK6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LMOD3Q0VAK6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LMOD3Q0VAK6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
LMOD3Q0VAK6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
LMOD3Q0VAK6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
LMOD3Q0VAK6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
LMOD3Q0VAK6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
LMOD3Q0VAK6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
LMOD3Q0VAK6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
LMOD3Q0VAK6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LMOD3Q0VAK6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LMOD3Q0VAK6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LMOD3Q0VAK6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LMOD3Q0VAK6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LMOD3Q0VAK6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
LMOD3Q0VAK6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
LMOD3Q0VAK6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
LMOD3Q0VAK6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LMOD3Q0VAK6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33■■■□□ 2.87
LMOD3Q0VAK6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LMOD3Q0VAK6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
LMOD3Q0VAK6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
LMOD3Q0VAK6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LMOD3Q0VAK6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LMOD3Q0VAK6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
LMOD3Q0VAK6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
LMOD3Q0VAK6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LMOD3Q0VAK6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
LMOD3Q0VAK6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
LMOD3Q0VAK6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
LMOD3Q0VAK6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
LMOD3Q0VAK6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
LMOD3Q0VAK6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
LMOD3Q0VAK6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
LMOD3Q0VAK6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
LMOD3Q0VAK6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
LMOD3Q0VAK6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
LMOD3Q0VAK6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LMOD3Q0VAK6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LMOD3Q0VAK6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
LMOD3Q0VAK6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LMOD3Q0VAK6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LMOD3Q0VAK6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
LMOD3Q0VAK6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
LMOD3Q0VAK6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
LMOD3Q0VAK6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
LMOD3Q0VAK6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
LMOD3Q0VAK6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
LMOD3Q0VAK6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
LMOD3Q0VAK6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
LMOD3Q0VAK6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
LMOD3Q0VAK6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
LMOD3Q0VAK6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LMOD3Q0VAK6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
LMOD3Q0VAK6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
LMOD3Q0VAK6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
LMOD3Q0VAK6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
LMOD3Q0VAK6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
LMOD3Q0VAK6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LMOD3Q0VAK6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
LMOD3Q0VAK6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
LMOD3Q0VAK6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
LMOD3Q0VAK6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
LMOD3Q0VAK6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
LMOD3Q0VAK6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LMOD3Q0VAK6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
LMOD3Q0VAK6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LMOD3Q0VAK6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
LMOD3Q0VAK6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
LMOD3Q0VAK6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
LMOD3Q0VAK6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LMOD3Q0VAK6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
LMOD3Q0VAK6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LMOD3Q0VAK6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.85
LMOD3Q0VAK6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
LMOD3Q0VAK6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
LMOD3Q0VAK6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
LMOD3Q0VAK6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
LMOD3Q0VAK6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
LMOD3Q0VAK6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
LMOD3Q0VAK6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LMOD3Q0VAK6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
LMOD3Q0VAK6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
LMOD3Q0VAK6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LMOD3Q0VAK6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LMOD3Q0VAK6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms