Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SSRP1Q08945 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SSRP1Q08945 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SSRP1Q08945 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SSRP1Q08945 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SSRP1Q08945 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SSRP1Q08945 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SSRP1Q08945 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SSRP1Q08945 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SSRP1Q08945 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SSRP1Q08945 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SSRP1Q08945 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SSRP1Q08945 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SSRP1Q08945 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SSRP1Q08945 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SSRP1Q08945 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SSRP1Q08945 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SSRP1Q08945 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SSRP1Q08945 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SSRP1Q08945 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SSRP1Q08945 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SSRP1Q08945 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SSRP1Q08945 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SSRP1Q08945 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SSRP1Q08945 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SSRP1Q08945 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SSRP1Q08945 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSRP1Q08945 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSRP1Q08945 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSRP1Q08945 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSRP1Q08945 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSRP1Q08945 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSRP1Q08945 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSRP1Q08945 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SSRP1Q08945 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SSRP1Q08945 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SSRP1Q08945 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SSRP1Q08945 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SSRP1Q08945 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SSRP1Q08945 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SSRP1Q08945 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SSRP1Q08945 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SSRP1Q08945 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SSRP1Q08945 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SSRP1Q08945 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SSRP1Q08945 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSRP1Q08945 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSRP1Q08945 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSRP1Q08945 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSRP1Q08945 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SSRP1Q08945 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SSRP1Q08945 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SSRP1Q08945 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SSRP1Q08945 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SSRP1Q08945 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SSRP1Q08945 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SSRP1Q08945 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SSRP1Q08945 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SSRP1Q08945 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SSRP1Q08945 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SSRP1Q08945 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SSRP1Q08945 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SSRP1Q08945 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SSRP1Q08945 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SSRP1Q08945 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SSRP1Q08945 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSRP1Q08945 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SSRP1Q08945 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SSRP1Q08945 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSRP1Q08945 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SSRP1Q08945 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSRP1Q08945 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SSRP1Q08945 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SSRP1Q08945 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SSRP1Q08945 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SSRP1Q08945 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SSRP1Q08945 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SSRP1Q08945 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SSRP1Q08945 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SSRP1Q08945 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SSRP1Q08945 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SSRP1Q08945 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SSRP1Q08945 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SSRP1Q08945 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SSRP1Q08945 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SSRP1Q08945 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SSRP1Q08945 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SSRP1Q08945 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SSRP1Q08945 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SSRP1Q08945 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSRP1Q08945 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSRP1Q08945 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSRP1Q08945 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSRP1Q08945 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSRP1Q08945 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSRP1Q08945 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSRP1Q08945 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSRP1Q08945 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSRP1Q08945 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SSRP1Q08945 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms